Depende…
A região da fralda é uma zona mais quente e húmida, pelo que a pele está sujeita a mais agressões do que noutras zonas.
Assim, se estiver mais irritada e vermelha a resposta é óbvia: sim, deve colocar!
No entanto, se a pele estiver saudável e íntegra, não é necessário fazê-lo. Não é propriamente errado, pelo que se for essa a sua vontade pode aplicar creme, mas na verdade não existe justificação para tal. Sei que, culturalmente, ainda existe muita ideia de que é necessário colocar creme no rabinho dos bebés sempre que se muda a fralda, mas, na maior parte das vezes, não precisa de o fazer.